中國醫學科學院、中國疾病預防控制中心等機構的研究人員近日對新發現的冠狀病毒（2019-nCoV）基因組進行了深入注釋，發現新型冠狀病毒與SARS或類SARS冠狀病毒存在一些差異。

在這項發表于《Cell Host & Microbe》雜志上的新研究中，研究人員對新型冠狀病毒與SARS病毒和類SARS病毒進行了系統比較，鑒定出這些冠狀病毒之間的380個氨基酸替換，而這些替換可能引起了新型冠狀病毒的功能性和致病性差異。

冠狀病毒在遺傳上分為四個屬：α冠狀病毒，β冠狀病毒，γ冠狀病毒和δ冠狀病毒。之前已鑒定出六種人類冠狀病毒，包括HCoV-NL63和HCoV-229E，它們屬于α冠狀病毒屬；以及HCoV-OC43、HCoV-HKU1、SARS-CoV和MERS-CoV，它們均屬于β冠狀病毒屬。

研究人員指出，冠狀病毒的基因組大約在26,000至32,000個堿基的范圍內，包括6-11個開放閱讀框（ORF）。第一個ORF約占整個基因組的67%，編碼16個非結構蛋白，而其余的ORF則編碼輔助蛋白和結構蛋白。四個主要的結構蛋白是刺突糖蛋白（S）、小包膜蛋白（E）、基質蛋白（M）和核衣殼蛋白（N）。其中，刺突蛋白在病毒與宿主細胞的結合中起著至關重要的作用，并決定了宿主的向性。SARS-CoV和MERS-CoV的刺突蛋白通過不同的受體結合結構域與不同的宿主受體結合。

在這項研究中，研究人員對三個最先測定的新型冠狀病毒基因組（HB01、HB04和HB05）進行了深入的基因組注釋，并將它們與相關的冠狀病毒進行了比較，包括1,008株人SRAS冠狀病毒、338株蝙蝠類SARS冠狀病毒和3,131株人MERS冠狀病毒。

在氨基酸水平上，研究人員發現新型冠狀病毒與SARS病毒非常相似，但也有一些顯著差異。例如，8a蛋白在SARS病毒中存在，但在新型冠狀病毒中卻不存在。8b蛋白在SARS病毒中有84個氨基酸，但在新型冠狀病毒中有121個氨基酸。“目前還需要進一步的研究來鑒定這些差異如何影響新型冠狀病毒的功能性和致病性，”作者寫道。

根據各種病毒全基因組的系統發育分析，研究人員發現新型冠狀病毒與MERS、SARS和類SARS冠狀病毒處于同一冠狀病毒進化枝上，但新型冠狀病毒與蝙蝠類SARS冠狀病毒的相似度最高，而與MERS冠狀病毒的親緣關系較遠。這些結果與之前發表的研究結論相似。

然而，盡管對全基因組和單個基因的系統發育分析明確表明新型冠狀病毒與蝙蝠類SARS冠狀病毒的親緣關系最近，但研究人員表示，他們還沒有找到蝙蝠病毒的單個毒株，其中所有蛋白質都與新型冠狀病毒的對應物高度相似。

“考慮到新型冠狀病毒與SARS病毒和類SARS蝙蝠病毒之間的親緣關系，分析不同蛋白質的氨基酸替換有望揭示新型冠狀病毒在結構和功能上與SARS病毒有何不同，”